Azonban még egy ilyen egészséges italnak is vannak hátrányai. Bármilyen jó is a zöld tea, az összetételében található tannin miatt felboríthatja a szervezet vas egyensúlyát, és megzavarhatja a magnézium és a kalcium felszívódását az élelmiszerekből. A tannin a nyálkahártyát is irritálhatja, ami a gyomor- és nyombélfekélyben szenvedők számára fontos.
Az allergiások pedig vigyázzanak a citrommal: a citrusfélék reakciót válthatnak ki. Nagy mennyiségben a citromsav károsíthatja a fogzománcot. Ezenkívül a krónikus gyomor-bélrendszeri betegségekben szenvedők nem fogyaszthatják a gyümölcsöt.